Amennyiben úgy hozza a sors, hogy Windowson futó programot kell elindítani, akkor több lehetőség kínálkozik:

• Abban az esetben, ha a Windows mellé telepítettük a Linux Mint-et, akkor újraindítva a rendszert induláskor elérhetjük a régi Windows telepítést.
• Másik megoldás, hogy a Windows operációs rendszert emulátorban futtatjuk. Ez egy olyan alkalmazás, amely képes virtuálisan számitógépeket futtatni, emulálni egy ilyen környezetet, és abban más operációs rendszert valamint rajta alkalmazásokat futtatni. Asztali környezetben ingyenesen elérhetők közül talán a VirtualBox, szerveren a KVM a legnépszerűbb emulátorok, de elérhető még a VMWare és a XEN megfelelő programjai is.
• Harmadik megoldás a Wine használata. Ebben az esetben a Wine linnuxos program alakítja át a Windows programok függvényhívásait a Linux alatti megfelelőre. Számos program kiválóan futtatható így is. WIndows és DOS programok is futatthatók ilyen módon.
• DOS-os programok futatthatók linuxos futtatókörnyezetben DOSBox-ban vagy DOSemu-ban.